様々な目的に応じた、配列解析からの解析、ターゲット遺伝子からの機能解析を提供いたします。
基本解析例
(Whole Genomeだけでなく、着目したFocused Genome領域のマッピング処理からの解析も効果があります)
- De novoシーケンス:モデル生物、非モデル生物ともに機能領域のアノテーション付加(微生物のORF探索含む)
- 1 6 S, 1 8 S, 5 S , 5 . 8 S, 2 3 S, 2 5 S , 2 6 S, 2 8 S等リボソーマルR N A遺伝子の配列をもとにした菌種分類
- Re-Sequence:既知ゲノムへのマッピング実行
- RNA-Seq解析: Alternative splicing候補エクソンの予測とその機能解析(エクソンアレイも対応しています)
- CHIP-Seq解析:Bindした下流遺伝子情報を利用した機能解析
- 非モデル生物遺伝子をモデル生物遺伝子に変換してからの機能解析
- 着目領域の頻度情報を利用した、表現型やその他の特徴をクラスター化して分類する解析、他
遺伝子からの機能解析例 (マイクロアレイ解析共通)
- 着目遺伝子群が関係する有意疾患や表現型の探索、着目遺伝子群に結合する化合物の探索
- 着目遺伝子群を用いた、GOや薬物代謝因子、シグナルパスウエイ等を基準としたエンリッチメント解析による有意遺伝子の判断
- 薬理作用を利用した着目遺伝子群の分類
- 薬物代謝とその制御因子になっている遺伝子の分類
- 表現型や生化学検査情報を利用した多変量解析(着目したFocused Genome領域の処理データ推奨)
- ネットワーク解析によるメカニズム探索(タンパク質、化合物、疾患等、表現型を使った探索で、目的に則したネットワークを作成)、他
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