遺伝子発現実験解析をご依頼の方、　発現実験後の解析処理のみの方

　弊社ではそのような方々に　ヒト、ラット、マウスなどの発現実験データのマイニングとして、有意な遺伝子の抽出・データのアノテーションとクラスタ解析やパスウェイ解析を行うサービスを提供します。
　P値やシグナル値、サンプル間比較、文献情報、パスウェイに記載されている優位性などを元に検定を行い、有意義な遺伝子の抽出を行います。スタンダードなカタログマイクロアレイのほか、エクソンアレイやタイルアレイの解析も対応可能です。　解析内容およびサンプル数によりお見積もりいたします。　お気軽にお問い合わせください。
解析サービスはチップのメーカー、チップの種類はとくに問いません。

　（＊追加オプション価格は、GeneChip発現実験を依頼された場合の追加価格です。
オプションプライス例（一サンプルあたり）：　後述１）および２）の標準サービス　受託解析実験価格に+50,000円、後述１）から４）のオプションを含むすべての解析を依頼した場合、受託解析実験価格に＋200,000円　注意：サンプル数などにより価格は変わります）。

ワールドフュージョンのマイクロアレイデータ解析・アノテーションサービスはこんな方々に最適

  • 発現データを解析したいが、自分で一からデータを解析していく時間と余裕がない。
  • 発現実験はおこなったが、そのあと最適な解析手法がわからない。
  • 発現データから目的遺伝子群を見つけたので、機能解析を進めたい
  • いままで行ってきた実験データを無駄にせず、新しいチップや異なるチップで実験したい
  • 違うメーカーのチップが混在していてうまくデータがまとまらない。
  • チップ付属のアノテーションリストを超え、疾患情報なども考慮したもっとディープなアノテーションをしたい。

マイクロアレイデータ解析・アノテーションサービス解析例

1）遺伝子の詳細アノテーション取得サービス

（標　準）　遺伝子の詳細アノテーションを提供します。各チップメーカーから配布されているアノテーションリストではなく、弊社の高水準のインフォマティクス技術から取得したアノテーションリストとなります。
　チップメーカーが配布しているアノテーションと比較し、当社のアルゴリズムにより約１０％以上のUnknownのプローブについてアノテーションが付加されています。また、これらのアノテーションは、ヒト、マウス、ラット、サル以外の種も対応できますのでお問い合わせください。（アルゴリズムについては個別お問い合わせ）

（オプション）　さらにオプションの拡張アノテーションとして、タンパク質名、関連疾患、オルソログ、ＧＯ、OMIM、パスウェイクラスター、研究領域分析、組織別発現情報、文献情報などご要望に応じ提供します。また、これらの詳細情報が記載された弊社内のＬＳＫＢサーバーへアクセスし、さらなる詳細情報を取得することもできます。

（その他参考）　タイルアレイでは、Coding領域、Non-Coding領域の分類、該当遺伝子、連続プライマー領域、miRNA情報など、さまざまな情報をアノテーションとして追加します。

2）P値、シグナル値、サンプル間比較による有意遺伝子の選択

　弊社作成のＥｘｃｅｌマクロを利用して、シグナル値およびP値を利用した有意プローブの絞込み、およびサンプル間の比較を行えます。

3）クラスタ処理

　有意遺伝子について、1.K-means、2. Forgyes、3. SOM　によるクラスタ処理を標準で準備しています。　解析結果は、ExcelもしくはGenoWiz解析ソフト*に入れてお返しします。
(*受託内容により解析結果と同時に納品いたします。）

4）パスウェイ解析

　パスウェイ情報は一歩進んだ遺伝子アノテーションとして利用されます。複雑なパスウェイ解析を弊社の技術でわかりやすく閲覧できます。
有意遺伝子の共通の制御因子や、ターゲット因子の探索、有意遺伝子を含む文献上の基本パスウェイの解検索、公共データベースで公開されているパスウェイとの比較、Human Curatedでのパスウェイなどさまざまな解析を提供します。解析結果はhtml, PathwayExpert フォーマット、PathwayStudioフォーマットでお返し、もしくはPathway Expert Limited Editionに入れてお返しします。
パスウェイ解析手法は目的によって多様です。事前に解析手法の相談をさせていただきます。

ビューワー

弊社では解析データを視覚的に閲覧、解析するツールとして、クラスタ解析ソフトウエアとしてGenoWizを、パスウェイ解析では、Pathway Expert Limited Edition、タイルアレイ用にGenomeViewerを、文献解釈用には、自然言語解釈を搭載したMedScan Readerを準備しています。
　詳細は別途カタログをご請求ください。