文献解釈からネットワーク・パスウェイ表示まで

PathwayExpert & Medscanはパスウェイ解析ツールで定評のあるAriadne Genomics社の文献情報と、発現実験データからネットワークおよび分子相互作用を推定するシステムです。現在デモツアーをおこなっています。お気軽にお問い合わせください。

PathwayExpertとMedscanの組み合わせは、発現実験データだけでなく、 タンパク質、分子間の相互作用をターゲットとされている方々にも質 の高い情報を提供いたします。今までのデスクトップ上でのパスウェ イ解析や、インターネットへアクセスして解析する手法に比べより多 くの情報を引き出すことが可能となりました。
PathwayExpertはプローブIDと発現数値データをそのままインポートす ると、自動的にプローブとマッチする分子を特定し、発現実験データ からそれぞれの分子間のネットワークを推定するだけではなく、さら にすでに文献中に存在する該当遺伝子と分子との関連情報も同時に表 示いたします。
また、タンパク質、分子間の相互作用の情報をすでにデータベースと して持っているのでキーワードからの関連情報の検索、さらには、手 持ちの文献、またはまとまったドキュメント情報を文脈解釈し、どの ような作用がお互いにあるかの解釈を行えるソフトでもあります。
WEBベースのビューワーで利用しやすくなっている他、ご自身のデータ の保存や、自由な解析が可能となっています。さらに、疾患、化合物、 組織などにご興味あるかたはさらに弊社LSKBとの連携でよりターゲット を絞った研究および検証を行うことが可能です。

文献検索のスピード化

MedScanは自然言語解釈に基づきPubMedやMEDLINEアブストラクト、および手元にあるテキストドキュメントから生物学的情報を自動的に抽出するシステムで、タンパク質、細胞、低分子とそれぞれの相互作用および制御機能を文脈から高速に抽出することが可能となっています。 MecScanを利用した場合約10000件の文献から情報を約１分で抽出します。

ネットワーク・パスウェイ解析と仮説の検証

WEBベースの検索結果参照およびパスウェイツール,PATHWAY EXPERT,から、それぞれの解析結果を細かく検証し、さらには、関連情報を描画することも可能となっています。

実験データの解釈

さらには、発現実験データやプロテオミクス情報の解析もこのパスウェイツールを利用して解析することも可能となっています。
発現実験データは様々なメーカー、種類のプローブIDと数値結果をインポートでき、そのなかから自動的に関連のある分子間、さらには文献上で関連性を認められている分子情報を同時に参照することが可能となっています。

機能拡張

ワールドユージョンでは今回、ARIADNE GENOMICS社と共同でLSKB (Life Science Knowledge Bank)からの遺伝子、疾患、化合物の関連性をマイニングした結果情報をMedScanにて文脈解析し、関連性を検証できるインターフェースを作成します。

MedScanの特徴

ワールドユージョンでは今回、ARIADNE GENOMICS社と共同でLSKB (Life Science Knowledge Bank)からの遺伝子、疾患、化合物の関連性をマイニングした結果情報をMedScanにて文脈解析し、関連性を検証できるインターフェースを作成します。