LSKB Overview & Concept
LSKB Bio Knowlege
LSKB Chem Knowledge
LSKB Database
遺伝子と疾患、化合物との関連性を検索表示、化合物構造から文献情報、化合物とタンパク質や疾患などの情報へ展開を可能に 文献解釈からネットワーク・パスウェイ表示まで コピー数解析の決定版 ドッキング、タンパク質モデリング、活性予測ツールいろいろ クラボウと共同開発した生活習慣病研究用アレイ

Pathway Studio FAQ

Entityとは何ですか？
Relationとは何ですか？
Pathwayはどのようにつくられていますか？
ユーザはパスウェイを作成できるのですか？
（エンタープライズ版のみ）PublicデータとPrivateデータの違いは？
デフォルトパスウェイデータを自分で編集して使うには？
遺伝子群の中から、共通するパスウェイを検索するには？
Searchから検索できるTermにはどのようなものがありますか？
（エンタープライズ版のみ）MedScanサーチ機能と、MedScan Information Extraction の違いは何ですか？
発現実験ファイルをインポートする際に最低必要な項目は何ですか？
Experiment Viewer に表示される発現値の値は、実際に取り込んだ発現実験ファイルに記載されている値ですか？
発現値を反映させたときパスウェイに表示される色は、実際に取り込んだ発現実験ファイルに記載されている値に基づいている色ですか？
Gene Set Enrichment Analysisとはどういうアルゴリズムですか？
Sub-Network Enrichment Analysis とはどういうアルゴリズムですか？
（SNEA）例えば制御因子Rとターゲット因子4つ（T1-T4)がある場合、次のどちらが有意であると計算されますか？　1）T1がログ比8でT2-T4が0のとき　2）T1-T4の全てが1.2のとき は？
SNEAの制御因子はProteinのみですか？
アルゴリズムによって上位にリストされたパスウェイを開いてみたところ、発現値LogRatioは特に大きくありません。本当に有意なのでしょうか？
ひとつの遺伝子が複数のプローブを持つ場合、どのプローブの値がEnrichment解析に使われますか？
MedScanはどうやって実行できますか？
発現実験ファイルをインポートしたのに発現値がパスウェイに反映されないのはなぜですか？
ユーザ数、セッション数とは何ですか？
Admin, power, editor, user とは何ですか？
Protein（遺伝子）の数が10万以上あります。対象がヒト、マウス、ラットだけにしては多すぎませんか？
（エンタープライズ版のみ）Proteinの名前の隣にある鍵のアイコンは何ですか？
（エンタープライズ版のみ）PrivateデータをPublicにするには？
（エンタープライズ版のみ）PrivateデータをPublicにする際に選択できるreplaceとmergeとは？
疾患のデータはどこから取得していますか？
DirectLinkとはどういう描き方ですか？
Shortest Linkとはどういう描き方ですか？
Add Neighbors (Expand Pathway)とはどういう描き方ですか？
Find Common Targets とはどういう描き方ですか？
Find Common Regulator とはどういう描き方ですか？
（エンタープライズ版）エンティティのリストに表示される項目（フィールド名）を変えることはできますか？
（エンタープライズ版）Pathway StudioはWEBブラウザで見ているため、各ページにはURLがあります。このURLを保存しておけば、後でそのページにリンクできますか？
パスウェイ作成時、リレーションをフィルタリングできますが、どれを選択すべきですか？
一度に表示できるエンティティの数はどれくらいですか？
ソフトウェアのアップグレード時に、データベースは影響を受けますか？