文献解釈からネットワーク・パスウェイ表示まで
遺伝子と疾患、化合物との関連性を検索表示することができます。
PathwayExpert's Support
Entityにはどのようなデータがありますか？
You can operate this easily after installation, and you will get the analysis result immediately.
Entityにはどのようなデータがありますか？
Relationとは何ですか？
Pathwayはどのようにつくられていますか？
デフォルトで入っているパスウェイの中の、SignalingLineとRegulomeは、どう違うのですか？
BuildPathwayはどのようにパスウェイを作りますか？
PublicデータとPrivateデータの違いは？
Publicデータを自分で編集して使うには？
遺伝子群の中から、共通するパスウェイを検索するには？
FindRelevantNetworkの検索対象となるパスウェイには、自分の作ったPrivateパスウェイも含まれますか？
Searchから検索できるTermにはどのようなものがありますか？
MedScanサーチ機能と、MedScanLiteratureMiningの違いは何ですか？
発現実験ファイルをインポートする際に最低必要な項目は何ですか？
ExpressionViewerに表示される発現値の値は、実際に取り込んだ発現実験ファイルに記載されている値ですか？
NetworkViewerに表示される発現値の値は、実際に取り込んだ発現実験ファイルに記載されている値ですか？
AnalyzeExperimentのアルゴリズムについて
FindDifferentiallyExpressedNetworkとはどういうアルゴリズムですか？
FindDifferentiallyExpressedGroupとはどういうアルゴリズムですか？
FindSignificantRegulatorとはどういうアルゴリズムですか？
p-valueはどれくらいなら信頼して良いですか？
アルゴリズムによって上位にリストされたパスウェイを開いてみたところ、発現値LogRatioは特に大きくありません。本当に有意なのでしょうか？
ImportEntityListから、SwissProtIDのリストをインポートしたいのですがうまくいきません。
データのソース別にパスウェイを作成することはできますか？
コマンドラインからMedScanを実行することはできますか？
発現実験ファイルをインポートしたのに発現値がパスウェイに反映されません。
ユーザ数とセッションの考え方にについて。
Manager1はユーザに数えられますか？
Proteinの数が8万数千あります。対象がヒト、マウス、ラットだけにしては多すぎませんか？
Proteinの名前の隣にある鍵のアイコンは何ですか？
PrivateデータをPublicにするには？
Editor権限でできることは？
疾患のデータはどこから取得していますか？
大量のパスウェイデータ（ResNetフォーマット）をインポートする方法は？
PrivateデータをPublicにする際に選択できるreplaceとmergeとは？
例えば制御因子Rとターゲット因子4つ（T1-T4)がある場合、次のどちらが有意であると計算されるか？ 1）T1がログ比8でT2-T4が0のとき 2）T1-T4の全てが1.2のとき
パスウェイを作成中に"Expandedpathwayfrom50entities[resultistoolarge.TRUNCATEDat500entities]"というエラーがでましたが、この意味は何ですか？
DirectLinkとはどういう描き方ですか？
ShortestLinkとはどういう描き方ですか？
ExpandPathwayとはどういう描き方ですか？
ExpandPathwayにて、stepの意味は何ですか？
FindCommonTargetsとはどういう描き方ですか？
FindCommonRegulatorとはどういう描き方ですか？
エンティティのリストに表示される項目（フィールド名）を変えることはできますか？
統計計算に用いるのはProteinのみですか？
MedScanしたデータはSaveすると全てPrivateデータになってしまうのですか？
PathwayExpertはWEBブラウザで見ているため、各ページにはURLがあります。このURLを保存しておけば、後でそのページにリンクできるのではないですか？
興味のある遺伝子が100あるので、これらからBuildPathwayを行いました。
BuildPathwayなどでリレーションをフィルタリングできますが、どれを選択すべきかわかりません。
薬剤投与の発現実験結果から、AnalyzeExperimentをしても、あまり良い結果が得られません。
BuildPathwayをする以外に、RelationSearchをする方法はありますか？
一度にGraphicalViewerに表示できるエンティティの数はどれくらいですか？
ソフトウェアのアップグレード時に、データベースは影響を受けますか？
