Benchware

Benchware^®Pantheon

Product information

　Benchware Pantheonは、化合物の構造データや生物試験で得られた活性データなどの情報の整理・フィルタリング・解析を統合された環境で実行するために開発されたソフトウェアです。直感的にわかりやすく、構造式を扱える『スプレッドシート』を中心に作業を進める事ができるようになっており、別々のファイルで保存してあった分子構造と活性データの各ファイルをスプレッドシート上にドラッグ&ドロップするだけで簡単に統合することができます。また、化合物のプロパティ計算・フィルタリング機能も兼ね備えております。データの整理・解析はもちろんの事、統合したデータを各分野の研究者間で“共有”するのにも威力を発揮します。更に、分子構造の3D表示機能も搭載しておりますので、生体高分子構造の表示も可能です。

　・種々のファイル形式に対応
　　○SD, MOL2, SMILES, SLN, MOL, PDBなどの各分子ファイル形式
　　○エクセル、CSV、TSVの各テキストファイル形式

　・利便性の優れたスプレッドシートを実装
　　○分子構造や活性データの入ったファイルをドラッグ&ドロップするだけで、
　　　データの読み込み・スプレッドシートへの表示が可能
　　○複数のデータファイルを簡単操作で統合
　　○ドラッグ操作で簡単にカラムの追加・入れ替えが可能
　　○各種プロパティ計算機能
　　○各データによるフィルタリング
　　など・・・

　・BW 3DEの3D機能を搭載しておりますので、低分子・タンパク質の立体構造も表示可能
　　また、PoweｒPointにオブジェクトとして組み込んで、スライドショー内で操作することも可能

　・作成した各種ファイルは、Project単位で一括管理・保存。円滑なデータ共有を実現

　・Perl/Pythonなどのスクリプト言語やEclipse上で新規機能を作成してカスタマイズする事も可能

　・Molecular Inventionソフトウェア『Benchaware Muse』の基本プラットフォームとして採用
　　また、ワークフローツール『KNIME』を組み込んで利用する事も可能

Features

　★ファイルをスプレッドシート上にドラッグ&ドロップするだけで、簡単にデータをインポートできます。
　　ほとんど全ての低分子構造用ファイル形式をサポートしておりますので、ファイル形式を気にすることなく、
　　作業を進める事ができます。

　★各データをProject単位で一括管理・保存できますので、保存場所が分散してしまう心配がありません
　　(任意の保存先を指定することも可能です)。
　　

　★複数のファイルを簡単に統合する事ができます。このとき、統合の基準となるフィールド名の
　　選択・重複データの上書きなどを指定する機能など、フレキシブルな設定ができます。
　　　　　　　　　　　　

　★3D表示機能も搭載されていますので、タンパク質構造の表示なども簡単に行なう事ができます。
　　また、Power Pointへオブジェクトとして組み込んで、スライドショー内で操作することもできます。
　　　　　　　　　　　　

　★BW Pantheon上にKNIMEを組み込んで利用することもできます。
　　　　　　　　　　　　

　★基本的な操作手順についてのビデオチュートリアル(英語版)が公開されています。
　　閲覧したい項目をクリックしてご覧ください。

　　解析を始める
　　　・新規プロジェクトを作成する

　　スプレッドシート上での基本操作
　　　・異なるデータファイルを統合する
　　　・選択データをExportする
　　　・列データをフィルタリングする
　　　・列データをソートする
　　　・Property計算を実施する

　　3D表示の基本操作
　　　・構造データの読み込み
　　　・ダイアログを利用したタンパク質残基・リガンド・原子の選択、及び分子表面の作成
　　　・マウスを利用したタンパク質残基・リガンド・原子の選択
　　　・3D画面をPower Pointへ組み込む