ドッキング解析用として、特別パッケージをご用意致しました。 これらは、標的タンパク質の構造を利用して、その活性部位に結合する低分子化合物をコンピュータ上で予測する “バーチャルスクリーニング”を実施するためのパッケージです。
●PDB(Protein Data Bank)から入手した標的高分子の編集や低分子構造の三次元化などの
ドッキング解析の準備を行う
●バーチャルスクリーニングを実行する
●算出したモデルに対し、複数のスコアで評価する
マシン固定ライセンスの各1ユーザ / 年間使用権or永久使用権
| モジュール名 | 概要 |
| SYBYL/Base | SYBYLの基本モジュール。分子の表示・保存・描画、など |
| Concord Sketch | 低分子の三次元構造を構築 |
| Biopolymer | 生体高分子解析用モジュール、タンパク質・核酸の構造辞書を搭載 |
| MOLCAD | 分子表面の作成と分子特性の割り当て |
| Surflex-Dock | 3種類のプローブ原子の集合“Protomol”を活性部位と見立て、それに低分子を重ね合わせるユニークな手法を採用したドッキングモジュール |
| CScore | 4種類の異なるスコア関数を用意。Surflex-Dockのスコア関数を含む計5種類のスコアによるコンセンサス評価も可能 |
アカデミック(年間使用権):90万円
官 公 庁(年間使用権):315万円
※企業の方、及び永久使用権をご希望の方は、
弊社までお問い合わせください。
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■ Macintosh版 ■ OS : MacOSX10.5のみ CPU : Intel Core2Duo 2.4GHz 以上 RAM : 2GB 以上 HDD : 200GB 以上 Graphics : NVidia GeForce8600 MGT など |
■ Windows版 ■ OS : Windows XPのみ CPU : Pentium4 2.4GHz以上 (Dual Core/Quad Core対応) RAM : 2GB 以上 HDD : 200GB 以上 Graphics : 別途、ご相談ください。 |
■ Linux版 ■ OS : RHEL WS4.0 (32 bit版) CPU : Pentium4 2.4GHz以上 (Dual Core/Quad Core対応) RAM : 2GB以上 HDD : 200GB以上 Graphics : 別途、ご相談ください |


