“バーチャルスクリーニングの世界”

 ドッキング解析用として、特別パッケージをご用意致しました。  これらは、標的タンパク質の構造を利用して、その活性部位に結合する低分子化合物をコンピュータ上で予測する “バーチャルスクリーニング”を実施するためのパッケージです。

解析内容:

●PDB(Protein Data Bank)から入手した標的高分子の編集や低分子構造の三次元化などの
 ドッキング解析の準備を行う
●バーチャルスクリーニングを実行する
●算出したモデルに対し、複数のスコアで評価する



パッケージ内容:


ライセンス数 / 形態:

マシン固定ライセンスの各1ユーザ / 年間使用権or永久使用権

モジュール構成:

モジュール名概要
SYBYL/BaseSYBYLの基本モジュール。分子の表示・保存・描画、など
Concord Sketch低分子の三次元構造を構築
Biopolymer生体高分子解析用モジュール、タンパク質・核酸の構造辞書を搭載
MOLCAD分子表面の作成と分子特性の割り当て
Surflex-Dock3種類のプローブ原子の集合“Protomol”を活性部位と見立て、それに低分子を重ね合わせるユニークな手法を採用したドッキングモジュール
CScore4種類の異なるスコア関数を用意。Surflex-Dockのスコア関数を含む計5種類のスコアによるコンセンサス評価も可能

参考価格(税別):

アカデミック(年間使用権):90万円
官 公 庁(年間使用権):315万円

※企業の方、及び永久使用権をご希望の方は、 弊社までお問い合わせください。

動作環境:

■ Macintosh版 ■
OS : MacOSX10.5のみ
CPU : Intel Core2Duo 2.4GHz 以上
RAM : 2GB 以上
HDD : 200GB 以上
Graphics :
 NVidia GeForce8600 MGT など
■ Windows版 ■
OS : Windows XPのみ
CPU : Pentium4 2.4GHz以上
(Dual Core/Quad Core対応)
RAM : 2GB 以上
HDD : 200GB 以上
Graphics : 別途、ご相談ください。
■ Linux版 ■
OS : RHEL WS4.0 (32 bit版)
CPU : Pentium4 2.4GHz以上
(Dual Core/Quad Core対応)
RAM : 2GB以上
HDD : 200GB以上
Graphics : 別途、ご相談ください

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